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Doctoral Thesis
2006

Funktionen charakteristischer Sequenzmotive endogener und toxischer mitochondrialer Proteine

Abstract (English)

In the course of their biogenesis, mitochondria take up nuclear encoded proteins from the cytosol continuously. Protein import at the mitochondrial outer membrane is mediated by TOM proteins and by TIM proteins at the inner membrane, respectively. Now and then, toxical proteins released by pathogenic bacteria to infected tissue can also reach mitochondria. The present dissertation provides new findings on the role of characteristical sequence motifs that can be identified in endogenous and toxical mitochondrial proteins. In an extensive project the importance of sequence motifs from mitochondrial metabolite carrier proteins in their biogenesis and function was investigated in more detail. It could be shown, that the positively charged presequence of the citrate carrier from Rattus norvegicus is not involved in mitochondrial targeting but rather serves as an internal chaperone. A conserved sequence motif, PX(D/E)XX(R/K), the Carrier Signature, which can be found in all mitochondrial carrier proteins, does also not represent a mitochondrial targeting signal, as could be proven by using the dicarboxylate carrier from Saccharomyces cerevisiae as a model protein. Even the translocation across the outer membrane, the insertion into the inner membrane and the following dimerization of the dicarboxylate carrier are processes occuring independently of the Carrier Signature. Instead, it was discovered, that the Carrier Signature is primarily necessary for the function of metabolite carrier proteins in the inner membrane. In another project it could be shown for the Map toxin from enteropathogenic Escherichia coli strains (EPEC), that it is directed to the mitochondrial matrix, mediated by its typical N-terminal presequence and by the TOM and TIM complexes, respectively. The Map toxin leads then to the fragmentation of the mitochondrial network independent of the mitochondrial fission machinery and to the loss of the mitochondrial membrane potential. Moreover, it could be proven, that an internal conserved sequence motif, WXXXE, is essential for cytotoxicity of the Map toxin in the cytosol and for fission of mitochondria. A lysine residue within the WXXXE sequence serves probably as a locus of sumoylation. The investigations show, that mechanisms of intracellular protein transport are not only important for the biogenesis of mitochondria, but can also be relevant for pathological processes.

Abstract (German)

Mitochondrien nehmen im Zuge ihrer Biogenese ständig kernkodierte Proteine aus dem Cytosol auf. Der Proteinimport wird in der mitochondrialen Außenmembran von TOM-Proteinen, in der Innenmembran von TIM-Proteinen vermittelt. Mitunter gelangen auch toxische Proteine in die Mitochondrien, die von pathogenen Bakterien an die infizierten Gewebe abgegeben werden. Die vorliegende Dissertation liefert neue Erkenntnisse zur Rolle charakteristischer Sequenzmotive, die sich in endogenen und toxischen mitochondrialen Proteinen nachweisen lassen. In einem umfangreichen Projekt wurde die Bedeutung von Sequenzmotiven mitochondrialer Metabolit-Translokatoren in deren Biogenese und Funktion näher untersucht. Es konnte gezeigt werden, dass die positiv geladene N-terminale Präsequenz des Citrat-Translokators aus Rattus norvegicus nicht an der mitochondrialen Zielerkennung beteiligt ist sondern als internes Chaperon dient. Ein in allen Metabolit-Translokatoren konserviertes Sequenzmotiv, PX(D/E)XX(R/K), die Carrier Signature, stellt ebenfalls kein mitochondriales Zielerkennungssignal dar, wie anhand des Dicarboxylat-Translokators aus Saccharomyces cerevisiae nachge-wiesen werden konnte. Auch die Translokation über die Außenmembran, sowie die Insertion in die Innenmembran und die nachfolgende Dimerisierung des Dicarboxylat-Translokators ist von der Carrier Signature weitgehend unabhängig. Stattdessen wurde entdeckt, dass die Carrier Signature primär für die Funktion der Metabolit-Translokatoren in der Innenmembran der Mitochondrien notwendig ist. In einem weiteren Projekt wurde für das Map-Toxin enteropathogener Escherichia coli ? Stämme (EPEC) gezeigt, dass es unter Vermittlung seiner typischen N-terminalen Präsequenz unter Beteiligung der TOM- und TIM-Komplexe in die Matrix der Mitochondrien dirigiert wird. Das Map-Toxin löst dann unabhängig von der endogenen mitochondrialen Teilungsmaschinerie eine Fragmentierung des mitochondrialen Netzwerks und den Verlust des Membranpotentials aus. Weiterhin konnte nachgewiesen werden, dass ein internes konserviertes WXXXE Sequenzmotiv für die Zytotoxizität des Map-Toxins im Cytosol und für die Spaltung der Mitochondrien essentiell ist. Vermutlich dient ein Lysinrest innerhalb der WXXXE-Sequenz als Sumoylierungsstelle. Die Untersuchungen zeigen, dass Mechanismen des intrazellulären Proteintransports nicht nur bei der Biogenese der Mitochondrien, sondern auch bei pathologischen Prozessen eine wichtige Rolle spielen können.

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Faculty of Natural Sciences
Institute
Institute for Microbiology

Examination date

2006-11-30

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German

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Classification (DDC)
570 Biology

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@phdthesis{Papatheodorou2006, url = {https://hohpublica.uni-hohenheim.de/handle/123456789/5073}, author = {Papatheodorou, Panagiotis}, title = {Funktionen charakteristischer Sequenzmotive endogener und toxischer mitochondrialer Proteine}, year = {2006}, school = {Universität Hohenheim}, }